More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1411 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1411  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 212 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  50.49 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 226 aa  114  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  27.45 
 
 		 230 aa  98.2  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 256 aa  94.7  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 232 aa  91.3  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 241 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.05 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.43 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  31.09 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5188  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948488  normal  0.0144297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.5 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  33.12 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  48.31 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>