More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5277 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  97.06 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  79.24 
 
 		 236 aa  384  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  80.09 
 
 		 229 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  50.46 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  48.65 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  47.93 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 243 aa  194  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 251 aa  104  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  30.05 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  25.13 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  25.49 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  25.51 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  24.75 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  22.55 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  22.06 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1411  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  26.39 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  22.39 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  26.48 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>