More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_09760 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  79.83 
 
 		 238 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  71.13 
 
 		 243 aa  345  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  65.55 
 
 		 243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  62.27 
 
 		 235 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  62.27 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  45.62 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  45.62 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  44.6 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  43.32 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  33.18 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  33.49 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  23.27 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  26.47 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  28.95 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  25.91 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>