More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4833 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 238 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  97.06 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  78.81 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  79.64 
 
 		 229 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  48.85 
 
 		 243 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  48.2 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  30.52 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  92  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  25.65 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  25.65 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  24.51 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  22.55 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  23.76 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  25.49 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  22.55 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  22.89 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  28.93 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  25.89 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1411  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  24.12 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  28.17 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>