More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4252 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  92.08 
 
 		 241 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  89.58 
 
 		 241 aa  447  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  76.27 
 
 		 242 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 234 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  70.35 
 
 		 241 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  51.66 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  46.95 
 
 		 231 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  50.75 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  49.75 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  50.25 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  45.41 
 
 		 256 aa  174  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  41.55 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  41.55 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  43.13 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  40.67 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 214 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  45.67 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.13 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 295 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 222 aa  118  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 247 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  35.87 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  35.35 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 222 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2445  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.247601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>