More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5631 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 228 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  58.6 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  57.21 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 242 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  53.28 
 
 		 241 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 241 aa  237  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  52.66 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  52.66 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  51.42 
 
 		 263 aa  197  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  49.77 
 
 		 274 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  52.26 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  47.14 
 
 		 256 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 275 aa  181  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  46.12 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  42.4 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  42.4 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  40.76 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 245 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 240 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 295 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 216 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 219 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  32.79 
 
 		 216 aa  95.1  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>