More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4046 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  46.41 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 211 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  36.06 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  35.55 
 
 		 230 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 211 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  39.89 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  39.42 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  40.19 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 284 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  38.46 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  38.5 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 275 aa  98.6  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  38.22 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  39.36 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  37.57 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  40.84 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  34.22 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>