More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0049 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  88.99 
 
 		 240 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  82.4 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  82.4 
 
 		 295 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  42 
 
 		 275 aa  148  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  41.36 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  43.22 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  39.17 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  42.71 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  43.37 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  41.12 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  42.08 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  39.27 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 214 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 223 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 		 223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  38.5 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 219 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 222 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 218 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 223 aa  89.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  36.72 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  36.31 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  32.96 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  33.16 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  26.44 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2445  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.247601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>