More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7930 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 221 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  41.63 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 218 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  42.08 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  36.5 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 241 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  41.58 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  41.58 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  39.55 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  39.55 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  39.62 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  36.23 
 
 		 230 aa  121  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  38.65 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  42.92 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  36.45 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 244 aa  95.1  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 245 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  38.15 
 
 		 230 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 239 aa  91.7  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  34.24 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 265 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>