More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1614 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 229 aa  213  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 229 aa  207  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  50.26 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  34.52 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  34.13 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 232 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 248 aa  98.6  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 254 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  35.11 
 
 		 250 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 250 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 250 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 240 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 293 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 233 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 241 aa  95.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 230 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.71 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 262 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 239 aa  92.8  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 239 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 251 aa  92  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 247 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 232 aa  91.7  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 231 aa  91.7  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 239 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 290 aa  88.6  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  34.07 
 
 		 263 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  27.44 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 248 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30 
 
 		 243 aa  88.2  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  27.52 
 
 		 228 aa  88.2  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>