More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1964 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 229 aa  470  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 246 aa  94.7  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 265 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 235 aa  88.2  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  28 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 244 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.93 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.64 
 
 		 257 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.64 
 
 		 257 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  28.93 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.64 
 
 		 257 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 242 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.64 
 
 		 257 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.64 
 
 		 257 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  31.77 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>