More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2930 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 239 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 227 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 234 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 240 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 219 aa  96.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 241 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 256 aa  96.3  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 241 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 217 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  34.78 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 245 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 237 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 241 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 234 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 263 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  34.57 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 238 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 231 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 224 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.65 
 
 		 239 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 232 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 223 aa  89.7  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 233 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 223 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 216 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  30.93 
 
 		 247 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 274 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 222 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.78 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 247 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 229 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 216 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 241 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 224 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 215 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 227 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 264 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 228 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 221 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 230 aa  85.5  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 232 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  33.33 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>