More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3363 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  50.26 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  37.7 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  36.57 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  36.57 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 251 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 257 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  34.21 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 240 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 226 aa  94.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  35.78 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  35.26 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 229 aa  91.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 227 aa  91.7  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 227 aa  88.6  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 232 aa  88.2  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 238 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.58 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 235 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  32.35 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  32.47 
 
 		 237 aa  85.1  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  33.5 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 237 aa  85.1  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 234 aa  84.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>