More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4108 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 254 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 251 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  34.65 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  33.18 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  32.13 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2253  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218359  normal  0.132912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3485  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122835  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1884  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 239 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 255 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 262 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 253 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 265 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 236 aa  94.7  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  35.08 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 262 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 262 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  29.46 
 
 		 263 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>