More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0778 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  77.13 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 221 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 221 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  56.22 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  60.39 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1038  transcriptional regulator, GntR family  59.36 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1118  GntR family transcriptional regulator  59.36 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.232597  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  46.57 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  45.98 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  45.09 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  41.74 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3445  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3280  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5787  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00572916 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0680  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 226 aa  158  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231512  normal  0.107075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3471  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  39.38 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3937  transcriptional regulator, GntR family  41.06 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0563072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1096  GntR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 277 aa  151  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 228 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3666  transcriptional regulator, GntR family  41.83 
 
 		 260 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0403  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  37.89 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  39.5 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3638  hypothetical protein  42.35 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4418  GntR family transcriptional regulator  42 
 
 		 236 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.494465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 231 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  37.18 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2161  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111337  normal  0.915655 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6280  transcriptional regulator GntR family  36.59 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  41.4 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  38.5 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5872  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5540  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3833  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.644681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1873  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3530  transcriptional regulator GntR  36.54 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4006  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.477565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3930  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709239  normal  0.547681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  35.09 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  39.53 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01480  hypothetical protein  37.62 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.909575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  39.2 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>