More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0485 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 229 aa  281  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 230 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  58.62 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  60.18 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  59.28 
 
 		 227 aa  267  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  58.64 
 
 		 230 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  58.64 
 
 		 230 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  58.37 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 239 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 239 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  52.1 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  54.75 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 260 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  49.78 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  36.78 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 223 aa  105  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.63 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  34.08 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 214 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  37.57 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  34.95 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  33.53 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.8 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>