More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0043 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  93.45 
 
 		 230 aa  424  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  93.39 
 
 		 228 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  90.45 
 
 		 242 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  86.82 
 
 		 222 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  78.1 
 
 		 222 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  74.53 
 
 		 237 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  74.53 
 
 		 222 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  75.12 
 
 		 230 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 240 aa  174  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  47.42 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  46.86 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  46.86 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  49.23 
 
 		 218 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  45.73 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  46.86 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  44.72 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  41.51 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  43.22 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 221 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  42.27 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  42.78 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  44.2 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  43.16 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  34.87 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  45.3 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.83 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  32.96 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>