More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4792 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  39.17 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  42.38 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  42.38 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  40.89 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  42.38 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  39.53 
 
 		 231 aa  118  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  38.68 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  38.21 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  38.21 
 
 		 216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  40.78 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  38.46 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  37.02 
 
 		 230 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  37.7 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 221 aa  98.2  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  40.94 
 
 		 215 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 214 aa  92.8  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 225 aa  92  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 274 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  37.13 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 257 aa  88.2  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 234 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 202 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>