More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3622 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  92.05 
 
 		 239 aa  447  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  91.63 
 
 		 239 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  91.81 
 
 		 233 aa  427  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  81.01 
 
 		 240 aa  400  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  80.75 
 
 		 239 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  70.71 
 
 		 239 aa  353  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  57.21 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  55.56 
 
 		 227 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  55.56 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  55.56 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  54.82 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 230 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 243 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  50.64 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  52.47 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  99  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.6 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  32.96 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 223 aa  95.9  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 223 aa  95.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 233 aa  95.1  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 221 aa  92  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 258 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  33.53 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>