More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1327 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  61.21 
 
 		 223 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  45.5 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  43.41 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  48.29 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  48.29 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  47.47 
 
 		 274 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 241 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  44.81 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  41.29 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  40.45 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  40.45 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  41.47 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  39.25 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 223 aa  128  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 229 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.89 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 234 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 295 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 248 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  36.41 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>