More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2971 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  463  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  67.56 
 
 		 231 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  44.33 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  42.27 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  42.92 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 		 233 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 231 aa  147  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  39.42 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  36.79 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 237 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  36.04 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 267 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6111  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  35.2 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.33 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.84 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>