More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6111 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_6111  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  52.02 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 231 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  52.2 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  50.73 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  36.4 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2967  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1967  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0532674  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3403  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 267 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  25.87 
 
 		 225 aa  85.1  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>