More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1967 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1967  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0532674  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 220 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  42.49 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  41.45 
 
 		 230 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2967  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  35.45 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  37.39 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6111  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 235 aa  99  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3403  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 237 aa  99  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  95.9  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  95.1  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0504  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0329427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  34.69 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  34 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31.13 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.81 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  30.06 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>