More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1667 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
226 aa  457  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  53.92 
 
 
232 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  55.66 
 
 
240 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  55.71 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  55.66 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  52.7 
 
 
240 aa  232  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
241 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  54.98 
 
 
238 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  54.98 
 
 
238 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  54.67 
 
 
234 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  55.56 
 
 
231 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  54.5 
 
 
238 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  55.07 
 
 
230 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  51.83 
 
 
240 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
234 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  51.42 
 
 
232 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  44.75 
 
 
237 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
239 aa  198  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
235 aa  198  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  48.82 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  46.45 
 
 
239 aa  194  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  47.93 
 
 
253 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
262 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  46.45 
 
 
237 aa  192  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  45.25 
 
 
220 aa  192  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  47 
 
 
255 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  47 
 
 
255 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  47 
 
 
258 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 
220 aa  191  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  46.26 
 
 
255 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  46.26 
 
 
255 aa  190  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  46.26 
 
 
238 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
220 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
222 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  46.26 
 
 
262 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  46.26 
 
 
262 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
220 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 
222 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  45.33 
 
 
214 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  44.34 
 
 
241 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  43.32 
 
 
234 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  43.81 
 
 
218 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  46.53 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
229 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  47.72 
 
 
250 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 
225 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
235 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
233 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 
229 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
231 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
234 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 
237 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
230 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
232 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 
215 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
231 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 
233 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
218 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
234 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
235 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 
217 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
265 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
238 aa  99  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 
231 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 
226 aa  98.2  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 
228 aa  98.2  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
230 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  32.52 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 
217 aa  92  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 
215 aa  92  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>