More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3123 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 219 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  71.56 
 
 		 219 aa  285  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  36.96 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 229 aa  111  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  38.89 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  38.61 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  36.63 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  34.15 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.8 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  41.61 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  36.95 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 240 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 233 aa  98.6  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>