More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3655 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  99.55 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  99.55 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  44.81 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  29.7 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  29.13 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  26.37 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  30.29 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.88 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>