More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2188 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  41.9 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  41.43 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 237 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  36.24 
 
 		 236 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  35.37 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  35.96 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 251 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  34.11 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31.75 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  30.05 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 262 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>