More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0037 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  92.96 
 
 		 213 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  92.96 
 
 		 219 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  92.96 
 
 		 219 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  37.81 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.5 
 
 		 226 aa  118  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  36.6 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  31.4 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  31.03 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 227 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 239 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  28.57 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  35.47 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 257 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  27.09 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  33.98 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  30.05 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 232 aa  95.1  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  31.41 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 245 aa  92  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 263 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>