More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2641 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  71.56 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 222 aa  124  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  37.32 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  38.95 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  38.35 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 233 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 254 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 251 aa  111  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  39.23 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  37.77 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 237 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  35.82 
 
 		 240 aa  107  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  36.32 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  43.14 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 222 aa  104  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  36.36 
 
 		 239 aa  104  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  33.82 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  37.67 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>