More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003675 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  100 
 
 		 224 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  55.96 
 
 		 224 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  55.45 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 223 aa  238  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 223 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 223 aa  234  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  51.6 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  41.29 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  37.88 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 226 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  35.32 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 234 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  30.85 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  30.18 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  30.21 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 229 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 242 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>