More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5984 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  96.02 
 
 		 226 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  95.13 
 
 		 226 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 240 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  67.49 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  57.21 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 268 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  42.66 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  42.13 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  44.6 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  40.58 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  39.64 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  39.49 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  39.49 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 245 aa  138  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  34.2 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  38.61 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 260 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  33.49 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 245 aa  98.6  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  30.2 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 209 aa  92.4  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>