More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3493 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 267 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  35.75 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  36.04 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 222 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  34.2 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  32.02 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  35.12 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  34.54 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  31.58 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 262 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 245 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 238 aa  88.6  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 268 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 232 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 245 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 262 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 262 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>