More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0293 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.78 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30.39 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 267 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  31.96 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 213 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 234 aa  95.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 290 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 251 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 253 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 274 aa  92  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.45 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.32 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0931  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  36.31 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 217 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  36.31 
 
 		 245 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>