More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1199 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  92.11 
 
 		 230 aa  414  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  76.39 
 
 		 221 aa  331  5e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  67.13 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 222 aa  284  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  63.47 
 
 		 222 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  63.47 
 
 		 222 aa  280  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  198  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  35.68 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 232 aa  114  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  32.14 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 257 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 217 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  30.85 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  28.12 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 213 aa  88.6  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  40.94 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.04 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 248 aa  84.7  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  25.54 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  84.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>