More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1812 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0931  GntR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 242 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5236  GntR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.877177 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4957  GntR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4868  GntR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2845  transcriptional regulator, GntR family  44.29 
 
 		 174 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0599584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 209 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  30.15 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  34.44 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  37.59 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  33.56 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  24.89 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  24.51 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0341  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  29.08 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  25.59 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>