More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5768 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 234 aa  270  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  31.88 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 267 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.15 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  36.64 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  31.21 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1118  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.232597  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1038  transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  31.78 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 251 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4957  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  28.67 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4868  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5236  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.877177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>