More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4868 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5236  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.877177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4868  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4957  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0931  GntR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  48.64 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  33.71 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 230 aa  88.6  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2845  transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0599584  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  31.09 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  27.69 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.12 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30.97 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  28.91 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  29.95 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  33.11 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5742  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  36.69 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>