More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6303 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  49.75 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  38.28 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  35.05 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 268 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  32.86 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  38.59 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  33.18 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  32.39 
 
 		 227 aa  101  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 229 aa  98.2  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.34 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 245 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 235 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 257 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  31.84 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  28.97 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>