More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5742 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5742  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.84 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  31.65 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  29.86 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26.88 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  28.5 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.06 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0931  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.47 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  30.12 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 230 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 232 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4868  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4957  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5236  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.877177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.22 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>