More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0931 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0931  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4868  GntR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5236  GntR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.877177 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4957  GntR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 		 218 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2845  transcriptional regulator, GntR family  44.72 
 
 		 174 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0599584  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  37.64 
 
 		 263 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  39.49 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  40.97 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.99 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  29.74 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  26.19 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  32.35 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5742  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0341  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  28.1 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  33.59 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  34.62 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 219 aa  72  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  26.84 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 229 aa  72  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  25.23 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>