More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1913 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  67.27 
 
 		 233 aa  279  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  56.13 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  47.14 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  44.65 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  34.65 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 253 aa  88.2  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 277 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 396 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  38.22 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 242 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0162  gluconate operon transcriptional repressor  27.88 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0161  gluconate operon transcriptional repressor  27.88 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0156  gluconate operon transcriptional repressor  27.4 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0154  gluconate operon transcriptional repressor  27.4 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0205  gluconate operon transcriptional repressor  27.4 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0183  gluconate operon transcriptional repressor  27.4 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.5 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  30.58 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>