More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1887 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  36.1 
 
 
219 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 
232 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  35.92 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
223 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
231 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  30.46 
 
 
227 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
223 aa  94.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
223 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  31.47 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
223 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
268 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
223 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30.39 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
235 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
239 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  30.05 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 
230 aa  86.3  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  31.91 
 
 
245 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
247 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
229 aa  85.5  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 
226 aa  85.1  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 
245 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
235 aa  84.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
267 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
234 aa  82  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 
232 aa  82  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
246 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  27.91 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  28.57 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
245 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  28.8 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
247 aa  79  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  29.38 
 
 
210 aa  79  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.6 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>