More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4366 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  85.52 
 
 		 222 aa  380  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  72.85 
 
 		 222 aa  320  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  72.85 
 
 		 222 aa  320  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  72.85 
 
 		 222 aa  320  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  43.26 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  38.21 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  34.88 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  37.5 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10166  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  31.82 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 237 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  31.34 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.43 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  38.56 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>