More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1710 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  71.69 
 
 		 219 aa  332  3e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  35.83 
 
 		 227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  35.53 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.85 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 267 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 268 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.05 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 232 aa  94.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 225 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  30.58 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1564  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 234 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  33.52 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>