More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2595 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4862  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556045  normal  0.353938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3670  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 250 aa  98.2  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 245 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2693  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.98 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  33.18 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  31.25 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 290 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 213 aa  85.5  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  33.52 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.79 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  26.63 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>