More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4215 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  82.03 
 
 		 221 aa  346  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 290 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 238 aa  94.7  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  31.82 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 239 aa  91.7  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 241 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 226 aa  88.2  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  30.26 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.82 
 
 		 226 aa  84.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  34.24 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  30.1 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  27.59 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>