More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3711 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  446  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  48.99 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  46.89 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  38.5 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  38.65 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 227 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8629  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  37.19 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  45.93 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 240 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 268 aa  98.2  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 209 aa  96.3  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 254 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  36.67 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 293 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  37.76 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  34.12 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>