More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4322 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.73 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  35.65 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.04 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 226 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 240 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  36.62 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  30.9 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  35.68 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  33.03 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.71 
 
 		 229 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 212 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 225 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 211 aa  88.6  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 215 aa  88.6  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 346 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>