More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2384 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  87.68 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  75.83 
 
 		 211 aa  318  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  73.93 
 
 		 211 aa  313  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  73.46 
 
 		 211 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  81.31 
 
 		 215 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  78.04 
 
 		 215 aa  305  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 211 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  75.85 
 
 		 211 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  67.14 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  68.12 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  56.25 
 
 		 223 aa  234  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  54.85 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  54.37 
 
 		 212 aa  221  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  51.44 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 244 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  43.37 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  43.54 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 249 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 262 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  32.39 
 
 		 263 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 262 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 262 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  30.88 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 229 aa  99.4  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 256 aa  99  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 232 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 255 aa  98.6  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 255 aa  98.6  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  33.82 
 
 		 230 aa  97.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 234 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 284 aa  96.3  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>