More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2798 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  84.68 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  62.74 
 
 		 222 aa  271  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  58.88 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 222 aa  232  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  55.45 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 222 aa  224  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  51.61 
 
 		 223 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  46.31 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  48.04 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  47.21 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 211 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  39.06 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  35.91 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 225 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  42.57 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  42.57 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  31.9 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 257 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>